Teilprojekte des SFB 535
Invasionsmechanismen und Replikationsstrategien von Krankheitserregern
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TP B10

Cis und trans mRNA-Splicing in Trypanosomen:
Funktionsanalysen der Interaktionen von
RNA- und Proteinkomponenten


Prof. Dr. Albrecht Bindereif
Institut für Biochemie (FB 08), Justus-Liebig-Universität, Gießen


Zusammenfassung

RNA-Prozessierung der polycistronischen Primärtranskripte bei Trypanosomen erfordert als essentielle Schritte sowohl trans-Spleißen als auch Polyadenylierung. Als Ergebnis tragen alle mRNAs jeweils eine kurze, nicht-kodierende Spliced Leader (SL) Sequenz an ih-rem 5’ Ende, die aus der SL RNA stammt. Zumindest bei einem Gen [für Poly(A)-Polymerase] gibt es auch ein internes Intron, welches durch cis-Spleißen entfernt wird, was eine parallele Prozessierung des polycistronischen Primärtranskriptes durch cis- und trans-Spleißen erfordert. Als cis-spleißspezifische Komponente wurde der U1 snRNP entdeckt und biochemisch charakterisiert. Aufbauend auf unseren bisherigen Arbeiten wollen wir uns in den nächsten drei Jahren auf die folgenden Schwerpunkte konzentrieren:

- Der trans-spleißosomale SL RNP aus Trypanosoma brucei: Identifizierung der SL RNP-spezifischen   Proteine und deren Funktionsanalyse

- Charakterisierung von weiteren, für das Trypanosomen-System spezifischen Komponenten der    Spleißmaschinerie, insbesondere des ungewöhnlichen U2 snRNPs: Bedeutung für die Erkennung
   der Spleißstellen

- Genomweite Identifizierung weiterer Genen mit internen Introns mittels eines genomischen    SELEX-Ansatzes

Als experimentelles System werden wir hauptsächlich T.brucei einsetzen, wo molekular-genetische Ansätze und das Genomprojekt am weitesten fortgeschritten sind.

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